بررسی تفاوت بیان ژن
مطالعه و مقایسه الگوی بیان ژنها میان گروههای کنترل و تیمار با استفاده از روشهای RNA-Seq و تحلیلهای آماری مرتبط.
پلتفرم تخصصی توالییابی نسل جدید
خدمات تحقیقاتی NGS برای پروژههای ژنومیکس، ترانسکریپتومیکس و متاژنومیکس
ژن فن پیشرو طب خدمات تحقیقاتی توالییابی نسل جدید را برای دانشگاهها، مراکز پژوهشی، شرکتهای زیستفناوری و تیمهای تحقیق و توسعه ارائه میدهد. این خدمات از انتخاب روش توالییابی و طراحی پروژه تا تولید داده، تحلیل بیوانفورماتیک و آمادهسازی خروجیهای قابل استفاده در مقاله، پایاننامه یا گزارش علمی را پوشش میدهد.
کاربردهای تحقیقاتی
چه زمانی به خدمات تحقیقاتی NGS نیاز دارید؟
خدمات تحقیقاتی NGS زمانی مناسب است که پژوهشگر بخواهد اطلاعات ژنتیکی، الگوی بیان ژن، ترکیب میکروبی، تغییرات اپیژنتیکی یا تنوع ژنومی را در مقیاسی گسترده بررسی کند.
انتخاب فناوری و روش تحلیل باید بر اساس سؤال پژوهش، نوع نمونه، تعداد گروهها، بودجه، کیفیت مورد انتظار و نوع خروجی نهایی انجام شود.
مطالعه میکروبیوم
بررسی ترکیب و تنوع جوامع میکروبی در نمونههای انسانی، حیوانی، محیطی، صنعتی یا کشاورزی.
توالییابی عوامل بیماریزا
توالییابی ژنوم ویروسها، باکتریها، قارچها یا باکتریوفاژها و بررسی ژنهای مقاومت و حدت.
اپیژنتیک و متیلاسیون
بررسی الگوهای متیلاسیون DNA و تغییرات اپیژنتیکی مرتبط با تنظیم بیان ژن.
پورتفولیوی خدمات
حوزههای اصلی خدمات تحقیقاتی NGS
دامنه نهایی هر خدمت پس از بررسی سؤال پژوهش، نوع نمونه، کیفیت داده و خروجی مورد نیاز مشخص میشود.
RNA-Seq و ترانسکریپتومیکس
بررسی ترانسکریپتوم، مقایسه الگوی بیان ژن و مطالعه تغییرات رونویسی در شرایط آزمایشی مختلف.
خدمات و تحلیلهای قابل ارائه:
ثبت درخواست این خدمت
- Total RNA-Seq و mRNA-Seq
- lncRNA، circRNA و Small RNA
- Single-cell RNA-Seq
- Differential Gene Expression
- Pathway و Gene Ontology Analysis
متاژنومیکس و میکروبیوم
مطالعه جوامع میکروبی نمونههای انسانی، محیطی، کشاورزی و صنعتی بدون وابستگی به روشهای کشت.
خدمات و تحلیلهای قابل ارائه:
ثبت درخواست این خدمت
- 16S، 18S و ITS rRNA Sequencing
- Shotgun Metagenomics
- طبقهبندی تاکسونومیک
- Alpha و Beta Diversity
- Functional Profiling
WGS و WES تحقیقاتی
توالییابی کل ژنوم یا اگزوم در پروژههای پژوهشی برای شناسایی و بررسی تنوع ژنتیکی.
خدمات و تحلیلهای قابل ارائه:
ثبت درخواست این خدمت
- Human WGS و WES
- Eukaryotic WGS و WES
- Variant Calling
- Variant Annotation
- تحلیل SNV، Indel و تغییرات ساختاری
توالییابی ژنوم میکروبی
توالییابی و تحلیل ژنوم باکتریها، ویروسها، قارچها و سایر میکروارگانیسمها.
خدمات و تحلیلهای قابل ارائه:
ثبت درخواست این خدمت
- Microbial Whole Genome Sequencing
- De novo Assembly
- Genome Annotation
- Phylogenetic Analysis
- بررسی ژنهای مقاومت و حدت
اپیژنتیک و متیلاسیون
بررسی تغییرات اپیژنتیکی و الگوهای متیلاسیون متناسب با سؤال و طراحی مطالعه.
خدمات و تحلیلهای قابل ارائه:
ثبت درخواست این خدمت
- DNA Methylation Analysis
- Bisulfite Sequencing
- Methylation Profiling
- مقایسه الگوهای متیلاسیون
- تحلیل ارتباط متیلاسیون و بیان ژن
تحلیل بیوانفورماتیک
پردازش، کنترل کیفیت، تحلیل آماری و تفسیر دادههای NGS متناسب با نوع پروژه پژوهشی.
خدمات و تحلیلهای قابل ارائه:
ثبت درخواست این خدمت
- کنترل کیفیت داده خام
- Alignment و Quantification
- تحلیل آماری و مصورسازی
- PCA، Heatmap و Volcano Plot
- آمادهسازی خروجیهای قابل استفاده در مقاله
مشاوره تخصصی
طراحی پروژه پیش از توالییابی
بسیاری از مشکلات مرحله تحلیل داده از تصمیمهای نامناسب در طراحی اولیه پروژه ایجاد میشوند. بررسی دقیق هدف مطالعه، نوع نمونه، تعداد تکرارهای زیستی، عمق توالییابی و روش تحلیل میتواند از اتلاف زمان و هزینه جلوگیری کند.
- انتخاب روش توالییابی متناسب با سؤال پژوهش
- بررسی نوع نمونه و شرایط آمادهسازی
- تعیین تعداد نمونه و گروههای مطالعه
- انتخاب عمق و پوشش مناسب توالییابی
- بررسی نیازهای تحلیل بیوانفورماتیک
- تعیین فرمت و سطح خروجیهای نهایی
تحلیل بیوانفورماتیک و خروجیها
ارزش دادههای NGS زمانی مشخص میشود که با پایپلاین مناسب، کنترل کیفیت و روشهای آماری متناسب با طراحی مطالعه پردازش و تفسیر شوند.
- گزارش کنترل کیفیت دادههای خام
- فایلهای FASTQ و خروجیهای پردازششده
- فایلهای استاندارد مانند BAM، VCF و Count Matrix
- جداول آماری و نتایج آنوتیشن
- نمودارهایی مانند PCA، Heatmap و Volcano Plot
- گزارش روش تحلیل و ابزارهای مورد استفاده
نوع و فرمت خروجیها بر اساس روش توالییابی، دامنه تحلیل و توافق انجامشده پیش از شروع پروژه تعیین میشود.
فرایند انجام پروژه
از طراحی مطالعه تا تحویل نتایج
مراحل پروژه بر اساس نوع خدمت و سطح تحلیل متفاوت است، اما مسیر کلی همکاری شامل طراحی، ثبت درخواست، دریافت نمونه یا داده، تحلیل و تحویل خروجی خواهد بود.
ثبت پروژه در پورتال1. بررسی سؤال پژوهش
بررسی هدف مطالعه، فرضیه پژوهش، نوع نمونهها و خروجی مورد انتظار.
2. طراحی پروژه
انتخاب روش توالییابی، تعداد نمونهها، عمق پوشش و مسیر تحلیل داده.
3. ثبت درخواست و ارسال نمونه
ثبت اطلاعات در پورتال و ارسال نمونه یا داده بر اساس راهنمای مربوط به خدمت.
4. تولید یا دریافت داده
انجام یا هماهنگی فرایند توالییابی و کنترل کیفیت اولیه دادههای تولیدشده.
5. تحلیل بیوانفورماتیک
پردازش داده، تحلیل آماری، مصورسازی و استخراج نتایج متناسب با طراحی پروژه.
6. تحویل خروجی و پشتیبانی
تحویل فایلها و گزارشهای توافقشده و ارائه توضیحات علمی درباره خروجی پروژه.
مخاطبان خدمات
همکاری با مراکز پژوهشی و تیمهای تحقیق و توسعه
خدمات تحقیقاتی ژن فن پیشرو طب برای پروژههایی طراحی شده است که به تولید، پردازش یا تحلیل دادههای ژنومیکس نیاز دارند. سطح همکاری میتواند از مشاوره طراحی مطالعه تا ارائه تحلیل کامل بیوانفورماتیک متغیر باشد.
دانشگاهها و مراکز تحقیقاتی
پژوهشگران و دانشجویان تحصیلات تکمیلی
شرکتهای زیستفناوری
تیمهای تحقیق و توسعه
آزمایشگاههای مولکولی و ژنتیک
مراکز پژوهشی حوزه پزشکی، کشاورزی و محیط زیست
برای طراحی یا ثبت پروژه NGS
آمادهاید؟
اطلاعات اولیه پروژه، نوع نمونه، تعداد گروهها و خروجی مورد انتظار را ارسال کنید تا مسیر مناسب توالییابی و تحلیل بررسی شود.